В центре сюжета фильма "Призрачный киллер" - студентка Фумика, которая после неудачного свидания сталкивается с необычным явлением. На пути домой она находит гильзу от патрона, использованного для убийства киллера Хидэо Кудо. С этого момента жизнь девушки кардинально меняется: теперь она способна видеть призрак Кудо и даже позволять ему вселяться в своё тело.
Этот неожиданный дар дает Фумике возможность обрести навыки настоящего киллера, что становится для неё одновременно и опасностью, и возможностью. Не радуясь новому соседству потустороннего гостя, она отправляется на очередное свидание, в то время как Кудо, ощущая тревогу за свою недавнюю знакомую, следует за ней.
Фильм сочетает в себе элементы фэнтези и боевика, добавляя нотку криминала. Сюжет разворачивается вокруг внутреннего конфликта Фумики, которая пытается понять, как использовать свои новые способности, не потеряв себя. В то же время призрак Кудо стремится защитить девушку от неизвестной опасности, которая, возможно, связана с его прошлым.
Ставки в этой истории высоки: будущее Фумики и судьба её новых навыков зависят от того, как она будет использовать необычное сосуществование с духом киллера. Их союз может стать ключом к разгадке тайн прошлого Кудо и помочь Фумике обрести уверенность в себе.