В центре сюжета фильма "Лунная афера" - необычная миссия тайного агента ЦРУ в Лондон. Его задача - найти знаменитого режиссёра Стэнли Кубрика и убедить его снять фильм о высадке на Луну, который будет использован в случае провала реальной космической миссии "Аполлон". Однако вместо встречи с Кубриком агент сталкивается с аферистом по имени Джонни. Вместо серьезного кинематографа, Джонни устраивает съемку на порностудии, где создается иллюзия невесомости благодаря марихуане.
Эта история переплетается с теорией заговора о том, что высадка американцев на Луну была подделкой. Сторонники этой теории утверждают, что все доказательства - фотографии, видеозаписи и образцы лунного грунта - являются фальшивками. В реальности же, несмотря на популярность таких взглядов в России, нет никаких подтверждений этому заговору. СССР и другие страны не сомневались в подлинности американских полетов, а селенографические координаты мест посадки миссий "Аполлон" были даже подтверждены советскими учеными.
Фильм "Лунная афера", несмотря на свою комическую форму, затрагивает серьезные темы доверия и реальности, играя с идеями конспирологии и показывая, как легко можно быть введенным в заблуждение.