Фильм "Папа закодировался" рассказывает историю Анатолия Снарова, который после лечения от алкогольной зависимости начинает смотреть на свою жизнь совершенно другими глазами. Он осознаёт, что у него есть семья - жена и дети, а также он занимает должность начальника ЖКХ в небольшом городке Сорочинске, но до этого момента все они были для него как бы несущественными.
Новый взгляд на жизнь заставляет Анатолия стремиться стать идеальным отцом и гражданином. Он с энтузиазмом берется за решение проблем города, однако его активность выходит за рамки обыденной работы чиновника. Снаров пытается улучшить жизнь горожан, но его инициативы настолько масштабны и неожиданны для окружающих, что они начинают воспринимать его как угрозу привычному укладу.
Окружение Анатолия, напуганное его новым рвением, решает действовать. Они понимают, что перед ними уже не тот пьяница Снаров, которого можно было игнорировать или манипулировать. Теперь это человек с ясным умом и твердыми намерениями. Именно поэтому они начинают кампанию по "раскодированию" Анатолия - то есть по возвращению его к старому образу жизни, где он был бы менее активен и не мешал бы устоявшемуся порядку.
В центре сюжета оказывается борьба между стремлением главного героя к переменам и консервативным сопротивлением со стороны тех, кто привык к определенному распорядку вещей. Фильм затрагивает темы личного роста, общественного изменения и столкновения интересов внутри маленького городка.