В центре сюжета фильма "Школа мистера Пингвина" - история учителя английского языка Тома, который находит на берегу моря маленького пингвина в критическом состоянии. Том спасает малыша, очищая его от мазута и водорослей, и пытается отпустить обратно в океан. Однако пингвин, следуя своему кодексу чести, решает остаться рядом с человеком, который ему помог.
Следуя за своим спасителем, пингвин становится неожиданным гостем в классе Тома, где учит детей основам английского языка и важности доброты. Несмотря на изначальное удивление и скептицизм, ученики постепенно привязываются к новому "учителю" и начинают проявлять больший интерес к учебе.
Со временем пингвин становится настоящим символом надежды и вдохновения для всех вокруг. Его необычный способ обучения помогает улучшить успеваемость класса, что привлекает внимание всей округи. Фильм показывает удивительные перемены, которые могут произойти, когда люди открывают свои сердца для неожиданных друзей и новых подходов к образованию.