Фильм "Чёрные тучи" рассказывает историю двух сестёр-близнецов Рекхи и Рашми, которые после трагической смерти отца оказываются одни в своём поместье. Рашми начинает отношения с Кишором, сыном управляющего, что вызывает недовольство у Рекхи, которая стремится защитить сестру от любых неприятностей и забывает о своей личной жизни. Рекха решает отправить Рашми в Париж, чтобы та могла учиться в художественной школе, а сама тем временем встречает Према, с которым вскоре объявляет о помолвке.
Перед свадьбой Рекха передаёт Рашми свою долю наследства. Однако в ночь помолвки происходит трагедия: Рекху пытаются убить, сбрасывая в реку. Все полагают её мертвой, но она чудом остаётся жива. Под видом своей сестры Рашми Рекха возвращается домой, чтобы выяснить, кто стоит за попыткой убийства и найти настоящего преступника.
Этот напряжённый сюжет разворачивается на фоне семейных драм и интриг, где каждая встреча и решение могут иметь роковые последствия. Сестры-близнецы, внешне неотличимые друг от друга, становятся участниками игры, в которой истина скрыта за маской обмана, а каждый шаг может привести к разгадке или усугубить тайну.