В центре сюжета фильма "Дочери китайского ботаника" - история двух женщин, чьи чувства разворачиваются на фоне строгой социальной обстановки Китая прошлого века. Главная героиня Ли Мин приезжает в дом к известному ученому-ботанику для прохождения стажировки и встречает там Ан, его дочь. Между девушками завязывается крепкая связь, которая перерастает в глубокую любовь.
В то время как общество вокруг них осуждает гомосексуальные отношения, Ли Мин и Ан пытаются сохранить свою тайну, наслаждаясь редкими моментами счастья вместе. Их чувства проверяются на прочность из-за строгих законов и предрассудков, которые угрожают их будущему.
История девушек наполнена нежностью и страхом быть обнаруженными, что делает каждую встречу с Анной уникальной. Они обе осознают риски своей связи, но не могут бороться со своим чувством к друг другу. Их любовь становится оазисом в пустыне жестоких норм того времени.
Фильм показывает, как сложно было двум женщинам найти место для своих истинных чувств в обществе, где они должны были скрывать свою любовь за маской социального одобрения. Сюжет картины сосредоточен на внутреннем мире героинь, их переживаниях и нелегком выборе между личным счастьем и требованиями общества.