В центре сюжета - напряженные события апреля 1988 года на острове Увеа в Новой Каледонии. Здесь разворачивается драматическая ситуация, когда группа сепаратистов-канаков захватывает в заложники тридцать жандармов. В ответ на это из Франции отправляется отряд в размере трехсот военных с целью восстановления порядка.
Ключевыми фигурами конфликта становятся Филипп Легоржу, капитан элитного подразделения жандармерии, и Альфонс Дьяну, лидер сепаратистов. Эти двое, находясь по разные стороны баррикад, вынуждены искать выход из сложившейся ситуации, пытаясь при этом не потерять своих моральных принципов.
Ситуация осложняется политическими обстоятельствами: на фоне президентских выборов в Франции ставки становятся чрезвычайно высоки. В такой обстановке порядок может быть восстановлен ценой отказа от моральных устоев, что ставит перед героями сложный выбор между долгом и совестью.
Фильм "Порядок и мораль" исследует темы морали, власти и ответственности в условиях кризиса. Он показывает, как личные убеждения и политические интересы могут пересекаться и вступать в конфликт, когда речь идет о защите идеалов и сохранении жизни.