В центре сюжета фильма "Вечная сакура" - таинственное исчезновение молодой женщины в небольшом японском городке, где каждый год проходит праздник цветения сакуры. Детектив по имени Харуки берется за расследование этого дела, которое на первый взгляд кажется обычным побегом от семейных проблем. Однако чем глубже он погружается в обстоятельства исчезновения, тем больше загадок обнаруживает.
Харуки начинает с опроса близких пострадавшей и быстро понимает, что девушка была вовлечена в местные тайны, которые скрывают не только её семья, но и весь город. По мере развития расследования детектив сталкивается с серией запутанных улик, каждая из которых приводит к новым подозреваемым.
Вокруг дела разгорается скандал, ведь репутация города стоит на кону - туристы и инвесторы привлекаются именно благодаря ежегодному празднику сакуры. Харуки чувствует давление со стороны местных властей, которые пытаются ускорить закрытие дела любыми средствами.
Расследование приводит детектива к старому делу о пропаже девушки, которая исчезла во время предыдущего цветения сакуры. Похоже, что между двумя случаями есть связь, и Харуки начинает искать подсказки в прошлом, чтобы понять настоящее.
С каждым днем напряжение нарастает, ведь время играет против детектива - чем дольше он не находит ответы, тем меньше шансов найти пропавшую живой. Харуки должен разгадать загадку вечной сакуры, прежде чем цветение закончится и вместе с ним уйдут последние следы исчезнувшей женщины.