В центре сюжета фильма "Проект «Альфа»" - капитан Владимир Чайка, который в ходе патрулирования советских территориальных вод сталкивается с неожиданной угрозой. Его корабль обнаруживает радиобуи, установленные западными разведслужбами, что приводит к напряженному конфликту. Чайка и его экипаж демонстрируют профессионализм, отражая нападение неизвестного противника.
Возглавляя свой отряд, капитан проявляет решимость и храбрость в борьбе за защиту государственных интересов. Несмотря на сложность ситуации, моряки успешно захватывают один из радиобуев и доставляют его на борт своего корабля. Этот инцидент становится ключевым моментом для дальнейшего развития событий, поднимая вопросы о шпионаже и международной напряженности.
Сюжет картины погружает зрителя в атмосферу холодной войны, где каждый шаг может иметь серьезные последствия не только для экипажа, но и для всей страны. В фильме раскрывается тема мужества и преданности долгу перед лицом врага, а также сложность морального выбора в условиях военного противостояния.