Фильм "Призрак виллы Натхов" рассказывает о необычной дружбе между мальчиком Банку и призраком, обитающим в старинной вилле Натх в Гоа. Семья главного героя переезжает в этот дом, который местные жители обходят стороной из-за таинственного жителя. Банку, не верящий в существование потусторонних сил, встречается с призраком и, вместо страха, находит в нем нового друга. Он называет его Бхутнатхом, сочетая слова "призрак" и имя владельца виллы. Дружба между мальчиком и духовным обитателем дома развивается стремительно, и они проводят вместе много времени.
В центре истории также оказывается сын призрака - Прияншу Чаттерджи, который пытается помочь душе своего отца обрести мир. Их взаимоотношения приводят к серии забавных и трогательных ситуаций, показывающих, как преодолеваются страхи и стереотипы о призраках. Фильм исследует тему дружбы между разными мирами, где детская наивность и открытость помогают разрушить мифы и предрассудки.