После событий двухлетней давности пути героев разошлись: Гинтоки Саката отправился в Альтану для исследования, Кагура преодолевает просторы космоса в поисках способа вернуть Садахару его прежнее состояние, а Шинпачи Согия старается сохранить остатки их общего дома. Мир кажется спокойным, но внезапно нависает новая угроза: остатки Тендошу, получившие неожиданную поддержку в лице Гориллы и его банановой атаки, нападают на Центральный терминал с целью вновь использовать Альтану для своих мрачных целей. В ответ на это друзья объединяются, чтобы защитить Эдо, исполнить последнюю волю Шоё Йошиды и спасти своё будущее. На кону стоит не только судьба города, но и их собственные жизни, ведь предстоит столкнуться с мощными противниками, которые готовы на всё ради достижения своей цели.
