В центре сюжета фильма "Корабли штурмуют бастионы" - выдающийся русский флотоводец Фёдор Ушаков. Это вторая часть кинодилогии, посвящённой его жизни и подвигам. События разворачиваются на фоне Наполеоновских войн, когда Франция стремится расширить свои владения за счёт захватнических походов.
В фильме показана борьба русского флота против агрессии, в частности - освобождение Италии союзными войсками под командованием великого А. В. Суворова. Важную роль играет операция адмирала Ушакова, благодаря которой была одержана победа в крепости Корфу.
Фёдор Фёдорович проявляет себя как талантливый и отважный военачальник, его тактика и стратегическое мышление приводят к решительным победам на море. Фильм демонстрирует героизм российских моряков и их вклад в историю Средиземноморья.
"Корабли штурмуют бастионы" продолжает рассказ о жизни Ушакова, начатый в первой части дилогии - фильме "Адмирал Ушаков". Зрителям представляется возможность погрузиться в эпоху великих сражений и узнать больше о том, как русский флот писал свою героическую историю на просторах Средиземного моря.