В центре истории фильма "Колокола Святой Марии" - отец О`Молли, который становится новым священником в церкви Святой Марии. Его предшественник был вынужден уйти из-за болезни, вызванной, по слухам, постоянными конфликтами с монахинями. Новый пастырь встречает энергичную и добрую Сестру Бенедикт, которая управляет приходской школой и мечтает о её возрождении.
Школа находится в плачевном состоянии, и единственный шанс на спасение - убедить богатого пожилого мизантропа, который недолюбливает детей, выделить средства на строительство. Он планирует захватить территорию церкви для создания парковки, что ставит под угрозу существование школы.
Отец О`Молли и Сестра Бенедикт объединяют усилия, чтобы спасти школу и изменить мнение упрямого мецената. Их совместная работа не только приводит к успеху, но и вызывает взаимные тёплые чувства между ними. Однако их радость омрачается печальным известием: у Сестры Бенедикт диагностирована ранняя стадия туберкулеза.
Фильм показывает борьбу за будущее школы и личные переживания героев, их взаимную поддержку и веру в лучшее. Несмотря на сложности, они не теряют оптимизма и надежды на спасение своего прихода и сохранение его духовных ценностей.
