В центре сюжета фильма "Убийство на «Ждановской»" - трагическое событие конца 70-х годов, когда в московском метро был убит офицер КГБ. События разворачиваются вокруг расследования, которое ведется сотрудниками милиции после того, как на одной из станций метрополитена происходит резонансное преступление. Заместитель начальника секретариата КГБ СССР майор госбезопасности Вячеслав Афанасьев становится жертвой сотрудников линейного отделения милиции 26 декабря 1980 года.
Из-за высокого статуса убитого и профессии самих убийц, дело об убийстве не получило широкой огласки в то время. Скрытность вокруг происшествия была связана с желанием избежать негативного резонанса, который мог бы повредить имиджу государственных органов. Однако со временем, уже после начала Перестройки и в 1987 году, детали этого дела стали известны общественности.
Фильм представляет собой политический кинодетектив, снятый по книге следователя, который занимался расследованием данного преступления. Сюжет картины погружает зрителя в атмосферу того времени и показывает сложность и запутанность расследования, где каждый новый факт может привести к неожиданным поворотам и раскрыть новые аспекты как самого убийства, так и системы, в которой оно произошло.