В далёком прошлом островок в Тихом океане был местом поклонения жителями гигантской бабочке Мотре, которая оберегала своё огромное яйцо. Однако природная стихия изменила планы: тайфун унёс яйцо и выбросил на японский берег, где его обнаружили рыбаки. Мотра с двумя феями-хранительницами обратилась к людям с просьбой вернуть священный объект, но те уже продали его корпорации для создания достопримечательности.
Когда Годзилла снова начал терроризировать Японию, человечество осознало свою ошибку и стало искать помощи у Мотры. Гигантская бабочка, вместе с двумя своими сородичами, прибывает на защиту страны. Встреча двух титанов становится неизбежной: Мотра против Годзиллы в эпической битве за будущее человечества.
Этот фильм является продолжением приключений Годзиллы и вводит в серию нового персонажа - Мотру, которая впоследствии станет одним из самых известных монстров жанра "кайдзю".
