В средневековом Таллине начинается череда загадочных событий: ночной сторож сталкивается с призраком, а в башне находят убитого охранника. Вскоре после этого происходят и другие подозрительные смерти. Аптекарь Мельхиор Вакенстеде берется за расследование этих таинственных дел. Его путь приводит к встрече с разнообразными персонажами: блудницей, священником, художником-иностранцем и еретиком.
В поисках ответов Мельхиор отправляется в монастырь Пирита, где обнаруживает давно забытую тайну. Параллельно аптекарь пытается разгадать причины внезапного отказа своей возлюбленной Кетерлин от помолвки с ним. С каждым шагом расследования Мельхиор все глубже погружается в мир интриг и загадок средневекового города, где правда скрыта за фасадом религиозных обрядов и обыденной жизни.
Фильм "Аптекарь Мельхиор. Призрак" представляет собой увлекательное путешествие по лабиринтам средневековой криминальной истории, где каждый новый поворот сюжета открывает перед героем все новые загадки и тайны.
