В центре сюжета фильма "Леон Морен, священник" - Барни, женщина, воспитывающая дочь в условиях войны и оккупации. Она чувствует одиночество и понимает, что шансы встретить мужчину у неё с каждым годом уменьшаются. В это время она также тайно симпатизирует Сопротивлению, как и многие жители её городка, которые по-разному относятся к присутствию оккупирующих сил.
Барни опасается за безопасность своей дочери, учитывая еврейское происхождение отца девочки. Она принимает решение крестить дочь и отправить её в деревню для защиты от возможных угроз. Однажды, проходя мимо церкви, Барни решает войти внутрь и выразить своё недовольство религией и церковными институтами. Её эмоциональный всплеск не находит отклика у молодого священника Леона Морена, который, к её удивлению, соглашается с критикой в адрес церкви.
Леон не только признаёт зашоренность и пафосность церковных обрядов, но и предлагает Барни погрузиться в глубины веры. Это предложение становится началом их духовного диалога, который постепенно переходит в более глубокие отношения между двумя персонажами. Их взаимодействие раскрывает сложные темы веры, морали и человеческих отношений на фоне военного времени.
Фильм исследует внутренний мир Барни, её поиски смысла жизни и духовного утешения в период хаоса и неопределённости. Леон Морен выступает в роли наставника и проводника, который помогает ей найти путь к самопознанию и возможно, к спасению.