Фильм "Однорукий самурай" рассказывает историю двух воинов - Ванг Конга, китайского меченосца с одной рукой, и Затоичи, японского самурая. Их пути пересекаются в результате трагических событий: Ванг Конг спасает мальчика от самураев, что приводит к жестокой резне среди крестьян. Убийцы начинают охоту за китайцем, стремясь уничтожить свидетелей.
Затоичи, в свою очередь, встречается с мальчиком, чей отец погиб в той бойне, и обещает позаботиться о нем. Путешествуя вместе, они сталкиваются с Ванг Конгом. Затоичи не доверяет ему из-за назначенной на его голову награды, но не знает, что местный босс заинтересован в их конфликте для усиления своего влияния.
Двое воинов, говорящих на разных языках и принадлежащие к разным культурам, оказываются врагами. Их противостояние оборачивается битвой, где выжить должен только один. В этой истории переплетаются темы чести, преданности и сложности выбора в условиях войны и предательства.