В центре сюжета фильма "Дау. Дегенерация" - секретный научно-исследовательский институт в СССР 1950-х годов, где проводятся эксперименты над животными и людьми с целью создания идеального человека. Научные работы переплетаются с оккультизмом, создавая атмосферу таинственности и ужаса. Руководство института, включая директора, ведет себя развязно: эротические приключения, пьянки и дебоши ученых становятся нормой.
Система закрыта от внешнего мира, но внутри нее кипит своя жизнь, полная порока и безумия. Генерал КГБ и его подчиненные предпочитают не вмешиваться в происходящее, закрывая глаза на происшествия. Однако ситуация обостряется, когда в институт прибывают представители радикальной молодежи крайне правой направленности.
Под видом испытуемых они проникают внутрь, чтобы искоренить моральное разложение среди сотрудников и исследователей. Их миссия - не только прекратить распущенность, но и уничтожить саму основу секретной науки, если это будет необходимо. Сюжет фильма погружает зрителя в мир, где границы добра и зла стираются, а моральные ценности подменяются безумными экспериментами во имя высшей цели.