Фильм "Загадочная кожа" рассказывает историю двух подростков, чьи жизни навсегда изменились после трагических событий в их детстве. Брайан, когда ему было восемь лет, обнаруживает себя в погребе своего дома с кровью из носа и без понятия о том, как он там оказался. С тех пор его жизнь наполнена страхами: темнота вызывает панику, он мочится во сне, а его сон преследуют кошмары.
Взрослея, Брайан становится одержимым идеей выяснить правду о том происшествии. Он уверен, что стал свидетелем инопланетного похищения и стремится найти доказательства своего необычного опыта. Его поиски приводят к серии странных и опасных встреч.
Второй главный герой фильма - Нил. Ему также восемнадцать, и он помнит теплые отношения с тренером своей малой лиги, которые начались в том же возрасте, когда Брайан потерял память о своем ночном приключении. Нил мечтает о воссоединении с тренером и повторении тех чувств, которые он испытал в детстве.
Оба подростка пытаются справиться со своими травмами и найти свое место в мире. Их пути пересекаются, когда они сталкиваются с необходимостью столкнуться лицом к лицу со своими прошлыми и понять, как эти события сформировали их настоящее. "Загадочная кожа" - это история о поиске истины, самопознании и попытках исцелиться от глубоких психологических ран.