В центре сюжета фильма "Отпущение грехов" - история ученика католической школы Бенедикта Стэнфилда, который на исповеди признается отцу Годдарду в неожиданном и трагическом событии. Бенджи рассказывает священнику о том, как во время шутки он случайно убил своего приятеля, Блэки, и спрятал его тело в лесу. Однако, когда отец Годдар решает проверить слова мальчика, он обнаруживает вместо тела лишь чучело. Это открытие заставляет священника задуматься о том, что произошло на самом деле шутка или нет.
Священник, несмотря на свое возмущение и желание разобраться в ситуации, не может выдать тайну исповеди. Но вскоре правда начинает проявляться все более отчетливо: во время следующей исповеди Бенджи сообщает Годдарду о том, что шутка превратилась в реальность, и священник действительно находит тело Блэки там, где говорил мальчик.
Ситуация усложняется еще больше из-за исчезновения Артура Дайсона, друга Бенджи. Этот таинственный случай добавляет напряжения в историю, заставляя зрителя задаться вопросом о том, что же на самом деле происходит между этими детьми и какой секрет скрывает их дружба.
Фильм исследует темы тайны исповеди, моральной ответственности и последствий сокрытия истины. Сюжет затрагивает глубокие вопросы веры и морали, показывая сложные отношения между священником и его прихожанином, а также влияние этих отношений на судьбы молодых людей.