В центре сюжета - Раймунд Григориус, профессор древних языков из Швейцарии. Его жизнь кардинально меняется в один момент: он спасает женщину от прыжка с моста и находит у нее дневник португальского писателя Амадеу ди Праду. Этот документ становится для Раймунда настоящим открытием, ведь в нем рассказывается о борьбе против авторитарного режима Салазара в Португалии.
Захваченный историей сопротивления и личностью автора дневника, Григориус отправляется в Лиссабон. Там он начинает погружаться в прошлое, пытаясь разгадать тайны жизни и смерти Амадеу ди Праду. В поисках ответов Раймунд встречается с людьми, которые знали писателя или были участниками тех событий.
Каждый новый собеседник раскрывает перед Григориусом новые страницы истории Португалии, а также личную драму и страсти того времени. Профессор не только исследует прошлое, но и переосмысливает свое настоящее, находя в нем новые смыслы и ценности.
История Амадеу ди Праду становится для Раймунда своего рода путеводителем по жизни, напоминая о силе духа и важности борьбы за свободу. Фильм "Ночной поезд до Лиссабона" - это путешествие не только в пространстве, но и во времени, где прошлое переплетается с настоящим, а личные истории героев сливаются с историей целой страны.