В центре сюжета фильма "Смерч 2" - студентка метеорологии Кейт, которая вместе со своими друзьями пытается исследовать торнадо в Оклахоме для учебного проекта. Их цель - распылить внутри смерча специальную смесь, способную его разрушить. Однако эксперимент заканчивается трагедией: трое из команды, включая бойфренда Кейт, погибают.
Пять лет спустя Кейт уже работает в офисе в Нью-Йорке, когда её находит Хави - единственный выживший из той катастрофы, кроме неё. Он убеждает её вернуться в Оклахому, где разгар сезона торнадо, и присоединиться к его команде с серьёзным финансированием.
На месте они сталкиваются с группой ютьюберов под руководством метеоролога-ковбоя Тайлера. Несмотря на опасность, команда Хави продолжает свою работу, стремясь не только изучить смерчи, но и найти способ их контролировать или даже уничтожать.
Возвращение в Оклахому заставляет Кейт переживать прошлые травмы, но также даёт ей шанс искупить вину за гибель друзей. С каждым новым торнадо, который они наблюдают и пытаются влиять на его ход, напряжение возрастает. Их исследования могут привести к прорыву в понимании природы этих разрушительных явлений или же закончиться новой катастрофой.
Фильм "Смерч 2" погружает зрителя в мир экстремальных исследований и непредсказуемой силы стихии, где героям предстоит столкнуться с собственными страхами и вызовами, чтобы изменить будущее изучения торнадо.