В центре повествования - Аналисан, простой житель деревушки из Тамилнада, чья жизнь меняется после вступления в Британскую индийскую армию. Солдаты не могут правильно произнести его имя и называют его Миллером, но амбициозный молодой человек начинает гордо носить это прозвище, представляясь капитаном Миллером.
События разворачиваются на фоне напряженной обстановки 1930-1940-х годов в регионе. Капитан Миллер становится свидетелем жестокостей и насилия, которые колониальные власти оказывают на местное население. Эти зверства становятся для него последней каплей, после чего он принимает решение покинуть армию.
Дезертировав, Миллер присоединяется к повстанцам, стремящимся освободить свою землю от британского господства. Его путь полон опасностей и моральных дилемм, но жажда свободы и желание бороться за справедливость придают ему силы продолжать борьбу.
Фильм "Капитан Миллер" погружает зрителя в атмосферу колониальной Индии, показывая борьбу одного человека против системы, его внутренние конфликты и высокие ставки, на которые он готов пойти ради своей мечты о независимости.