В центре сюжета фильма "Беги, мальчик, беги" - история восьмилетнего мальчика, который становится беглецом после трагедии в варшавском гетто. Его семья погибла, и он остался один на улицах оккупированного города. Судьба сводит его с доброй полькой, которая решается скрыть его у себя дома. Она убеждает мальчика выдавать себя за осиротевшего поляка-католика, чтобы обеспечить ему безопасность.
Однако мир вокруг них полон опасностей, и вскоре мальчику приходится покинуть приют, который стал для него временным домом. Он отправляется в долгое и полное рисков путешествие по стране, раздираемой войной. В его одиссее ему помогают различные польские семьи, каждая из которых играет ключевую роль в его борьбе за выживание.
Мальчик сталкивается с множеством испытаний на пути к спасению: он переходит от одного убежища к другому, стараясь избегать немецких патрулей и шпионов. Каждый новый день приносит новые опасности, но также и надежду на то, что он сможет вырваться из этого кошмара оккупации.
Фильм показывает не только ужасы войны, но и силу человеческого духа, способность к состраданию и взаимопомощи в самые темные времена. Это история о том, как доброта и поддержка могут стать спасательным кругом для тех, кто оказался на грани выживания.