В продолжении "G.I. Joe: Бросок кобры" команда элитных солдат сталкивается с неожиданным предательством. Президент США оказывается поддельным, а настоящий лидер страны - заложником в руках злодея Зартана. В результате хитроумной операции по всему миру разносится ложная информация о том, что G.I. Joe причастны к краже ядерного оружия и государственной измене. После внезапного авиаудара, который должен был уничтожить команду, в живых остаются лишь несколько бойцов: Роудблок, Флинт и Леди Джей.
Оставшиеся в живых герои решают восстановить свое доброе имя и отомстить за погибших товарищей. Они начинают собственное расследование и обнаруживают, что Зартан планирует использовать ядерные ракеты для уничтожения всех правительственных зданий в Вашингтоне, чтобы установить свой диктаторский режим.
Герои G.I. Joe объединяются с бывшим членом "Кобры" Дьюком, который ранее был обманут и осужден за преступления, которых не совершал. Вместе они разрабатывают план по освобождению настоящего президента и предотвращению катастрофы.
Фильм наполнен динамичными сценами боя, трюками и спецэффектами, демонстрируя мастерство боевых искусств и тактического планирования команды G.I. Joe. Герои сталкиваются с моральным выбором и физическими испытаниями на пути к своей цели - спасению страны от тирании и восстановлению чести своего отряда.
