В мире будущего, где кибертехнологии проникли в каждый аспект жизни, элитный подразделение полиции возглавляет майор Мотоко Кусанаги - уникальный киборг-гибрид. Она и её команда специализируются на борьбе с преступлениями, перенесшимися из реального мира в виртуальное пространство. Новое поколение хакеров, вооруженных передовыми технологиями, становится все более опасным противником.
На этот раз майор Кусанаги преследует таинственного хакера, который оставляет за собой след из разрушений и хаоса в виртуальной сети. Каждое новое столкновение с преступностью раскрывает всё больше загадок о самой Мотоко - её происхождении, идентичности и месте в мире, где границы между человеком и машиной стираются.
В погоне за хакером майор сталкивается с вопросами собственной природы и смысла существования. Её миссия приводит к серии событий, которые ставят под сомнение основы её восприятия реальности и заставляют переосмыслить своё предназначение в борьбе против преступлений нового типа.
С каждым шагом к разгадке личности хакера майор Кусанаги углубляется в лабиринт виртуальных ловушек, где каждый бит информации может стать ключом к пониманию как себя, так и врага. В этой игре на выживание, где физический мир переплетается с цифровым, Мотоко должна использовать все свои способности, чтобы предотвратить катастрофу глобального масштаба.