Фильм "Меркурий в опасности" рассказывает историю девятилетнего мальчика по имени Саймон, обладающего исключительными способностями к расшифровке кодов. Он случайно раскрывает секретный правительственный код, предназначенный для того, чтобы быть неподвластным взлому. Это открытие ставит под угрозу миллиардный проект и становится серьезной проблемой для властей.
Саймон привлекает внимание Ника Кудроу, руководителя программы, который видит в мальчике угрозу национальной безопасности. Кудроу приказывает устранить Саймона, но его планы нарушает Арт Джеффрис - сотрудник ФБР, который решает защитить ребенка.
Джеффрис понимает, что Саймон в опасности не только из-за своих способностей, но и потому, что информация о нем может попасть к врагам США. Он берет мальчика под свою опеку, и вместе они становятся мишенью для жестоких убийц.
Преследуемые и без того уже осознающими, что доверять некому, Саймон и Джеффрис пытаются выжить в условиях, когда каждое новое место может стать ловушкой. Время работает против них, но у детектива появляется план: использовать умственные способности мальчика для того, чтобы обратить угрозу против тех, кто ее создал.
История превращается в напряженную игру в кошки-мышки, где каждый шаг может стать последним. Джеффрис и Саймон должны найти способ не только спасти себя, но и раскрыть заговор внутри самой системы безопасности страны.
