В центре сюжета фильма "Вымирание - Хроники генной модификации" оказывается Том Келлер, который становится свидетелем апокалипсиса: мир охватывает вирусная эпидемия, превращающая заражённых в агрессивных монстров. Том находит убежище на заброшенной военной базе и пытается установить связь с другими выжившими через радио. Однако его попытки оказываются тщетными.
После двух недель уединения, в ходе ночного рейда за припасами в городскую зону, Том встречает группу людей, которые также сумели пережить катастрофу. Среди них есть тот, кто раскрывает ему тайну происхождения вируса - все указывает на эксперименты с генной модификацией. Это открытие становится для Тома шоком, ведь оно поднимает вопросы о том, как далеко может зайти наука в погоне за прогрессом.
Ситуация усложняется тем, что вирус не перестаёт мутировать, делая противников всё более опасными и изощрёнными. Выжившим приходится постоянно адаптироваться к новым условиям борьбы за выживание. Том и его новые союзники должны найти способ остановить распространение эпидемии и восстановить мир, который они знали до катастрофы. Их путь полон опасностей, но именно они могут стать ключом к спасению человечества от неминуемого вымирания.