В центре сюжета фильма "Агент Хамилтон: В интересах нации" - специальный агент Карл Гамильтон, который выполняет секретную миссию в районе границы между Узбекистаном и Афганистаном. Его задача - проникнуть в тайные структуры русской мафии, занимающейся незаконным оборотом оружия. Мафия успела завладеть уникальными GPS-управляемыми артиллерийскими снарядами, которые были экспортированы шведской компанией Nordfors.
В ходе операции происходит неожиданное нападение группы наемников, которые уничтожают всех членов мафии, кроме Гамильтона. Наемники забирают с собой похищенные снаряды и исчезают в неизвестном направлении. Параллельно разворачивается еще одна драматическая линия: шведский оружейный техник оказывается похищенным и удерживаемым в тюрьме Сомали.
В ответ на ситуацию премьер-министр Швеции принимает решение о проведении спасательной операции. Для этого привлекаются услуги американской частной охранной компании Sectragon, при условии присутствия шведского наблюдателя - агента Гамильтона. Он присоединяется к операции по освобождению техника, но его интуиция подсказывает ему, что не все так просто.
Гамильтон начинает подозревать, что за происходящим стоят более серьезные игроки, и что кто-то из участников миссии скрывает правду. Он решает докопаться до истины и выяснить, какие тайные игры ведутся на фоне военных действий и международных интриг.