В центре сюжета фильма "Зараза" - борьба правительственных агентов против смертоносного грибка-паразита, который способен быстро размножаться и контролировать сознание своих носителей. После успешной ликвидации всей зараженной популяции последний образец грибка был укрыт в секретном подземелье. Проходит 18 лет, и бывшее хранилище превращается в склад для индивидуального хранения. Двое работников ночной смены, не подозревая об опасности, решают исследовать нижние уровни объекта. Их любопытство приводит к катастрофе: из-за глобального потепления система охлаждения выходит из строя, и грибок начинает свое смертельное распространение. Герои фильма оказываются в ловушке, где каждый шаг может стать последним, а борьба за выживание обостряется с каждой минутой.