В центре сюжета фильма "Робот Заборгар" - секретный полицейский Ютака Дэймон, который после смерти своего отца ученого получает в наследство могучего робота Заборгара. Этот высокотехнологичный боец оснащен мощным арсеналом оружия и способен трансформироваться в мотоцикл, а также является мастером каратэ. Дэймон использует необычные способности своего нового союзника для борьбы с преступной организацией Сигма, во главе которой стоит злой гений Доктор Акуномия, виновный в смерти его отца.
Конфликт между героем и антагонистом обостряется, когда Дэймон вступает в отношения с мисс Борг - главным помощником Доктора Акуномии, которая также является киборгом. Неожиданно связь Ютаки с роботом Заборгаром прерывается из-за возникших чувств.
Спустя 25 лет после этих событий, разжалованный Дэймон возвращается на службу в полицию. Причиной его возвращения становится новость о том, что организация Сигма завершила строительство гигантского разрушительного робота. Встает вопрос: сможет ли Заборгар вновь прийти на помощь своему хозяину и остановить злодеев?