В центре сюжета фильма "Дело о мятеже на "Кейне" - драматический конфликт между капитаном Куиггом и его старпомом лейтенантом Мэриком, разыгравшийся на борту американского эсминца в Персидском заливе. Сильный шторм ставит корабль и экипаж на грань выживания, и когда психическое состояние капитана начинает вызывать сомнения у его подчиненных, Мэрик решается на отчаянный шаг - он отстраняет Куигга от командования. Считая, что капитан не в состоянии адекватно управлять кораблем в критической ситуации, Мэрик берет бразды правления в свои руки.
Два месяца спустя лейтенант предстает перед военным трибуналом по обвинению в мятеже. Он отрицает свою вину и вместе с адвокатом готовится доказать, что Куигг страдает серьезными психическими расстройствами, которые не позволяют ему командовать кораблем в экстремальных условиях. Суд над Мэриком превращается в битву умов, где на кону стоит не только его будущее, но и принципы военной дисциплины и лояльности.
Фильм исследует сложные моральные дилеммы, с которыми сталкиваются моряки, когда личная смелость и долг перед страной вступают в противоречие. "Дело о мятеже на "Кейне" заставляет зрителя задуматься о границах подчинения и власти, а также о том, что иногда ради спасения команды необходимо нарушить устоявшиеся правила.
