В центре сюжета фильма "Затерянные в Йонкерсе" - история двух братьев, Якова и Артура, которые оказываются на попечении у своей строгой бабушки во время Второй мировой войны. Их отец, работающий в торговле антиквариатом, вынужден часто отсутствовать из-за своих деловых поездок после смерти матери мальчиков. Бабушка, приехавшая из Германии и обладающая непростым характером, вызывает у внуков страх и неприязнь своим жестким нравом.
Однако под маской строгости скрывается женщина с трудной судьбой, которая, возможно, не так уж и безжалостна. В доме также обитает ее сын Лу - гангстер, находящийся в бегах от мафии. Несмотря на свою криминальную репутацию, дядя Лу находит общий язык с мальчиками, становясь для них не только другом, но и союзником в их приключениях.
Главная мечта братьев - заработать девять тысяч долларов, чтобы помочь отцу расплатиться с долгами по лечению умершей матери. В этом они находят поддержку у дяди Лу, который помогает им видеть светлые стороны жизни даже в такой сложной обстановке.
Фильм показывает, как тяжелое испытание приводит к неожиданному укреплению семейных уз и взаимопониманию между поколениями. Несмотря на внешнюю жесткость и строгость, бабушка проявляет заботу о своих внуках, а мальчики учатся ценить то, что у них есть, несмотря на отсутствие отца и сложности, с которыми сталкивается их семья в военное время.