В далёком будущем мир пережил катастрофу: вирус уничтожил большую часть населения Земли, оставив выживших в изоляции под куполом единственного города. В этом постапокалиптическом мире действует загадочная Эон Флакс - агент с неясными мотивами и опасным талантом к боевым искусствам. Её цель - политический лидер, влияние которого распространяется на каждый уголок этого нового общества.
Эон обладает исключительной ловкостью и мастерством в рукопашном бою, что делает её одним из самых эффективных агентов секретной службы. Однако её миссии часто окутаны тайной, и даже она сама не всегда понимает истинные причины своих действий. В мире, где правда и вымысел переплетаются, Эон становится ключевой фигурой в игре за власть.
Её последнее задание приводит к серии событий, которые ставят под сомнение всё, во что она верила. Каждый шаг может быть ловушкой, а каждый союзник - врагом. В погоне за ответом на вопросы о своём предназначении и судьбе человечества, Эон Флакс должна разгадать загадку своего прошлого и определить будущее мира.
С каждым новым заданием она всё ближе подходит к разгадке тайн власти, которые могут изменить ход истории. Но кто стоит за кулисами? И какие секреты скрывает город под куполом? Эон должна найти ответы, прежде чем время выйдет и будущее будет потеряно навсегда.