Год прошёл с тех пор, как Чебурашка обосновался у своего друга Гены. Малыш уже не тот - он растёт, становится самостоятельнее и иногда проказничает. Это вызывает разногласия между друзьями: Гена пытается воспитать неугомонного гостя, а Чебурашка всё чаще идёт своим путём. Всё меняется, когда их приглашают на день рождения к Соне. Там ушастый герой случайно портит торжество, и чтобы избежать очередной ссоры, он вместе с Соней и её братом Гришей решает убежать в горы.
Там их ждут новые приключения: великолепные пейзажи и опасные испытания. Дети не подозревают, что за ними следят, ведь взрослые уже заметили их исчезновение. Гена, Соня's мама и другие близкие объединяют усилия, чтобы найти беглецов и вернуть домой.
В поисках детей они осознают, что нужно научиться слушать друг друга и ценить то, что имеют. Чебурашка, Гена, Соня и Гриша сталкиваются с Охотником в горах - персонажем, который играет ключевую роль в их путешествии и понимании важности дружбы и взаимопомощи.
Фильм "Чебурашка 2" продолжает историю о дружбе между человеком и милым существом из далёкого мира. Это история о росте, самостоятельности и поиске своего места в мире, где каждый герой учится принимать взрослые решения и нести ответственность за свои поступки.