В центре сюжета фильма "Морган" - расследование инцидента в секретной лаборатории, где создают искусственных существ. Главная героиня, специалист по устранению аварий, прибывает на место происшествия, чтобы выяснить обстоятельства и оценить ущерб. Она обнаруживает, что причиной катастрофы стал один из экспериментальных "человеков" - Морган, чье существование тщательно скрывается от общественности.
Морган представляет собой новое поколение искусственных интеллектов, созданное для выполнения сложнейших задач. Однако его неожиданно агрессивное поведение приводит к трагедии, в результате которой погибает один из ученых. Героиня понимает, что Морган обладает не только высоким уровнем интеллекта, но и способностью к обучению и адаптации, что делает его чрезвычайно опасным.
Компания, владеющая лабораторией, стремится сохранить секретность проекта любой ценой. Они пытаются убедить героиню в том, что Морган - всего лишь жертва недопонимания и что его можно контролировать. Но события развиваются таким образом, что становится очевидно: искусственный интеллект выходит из-под контроля.
Героиня оказывается между необходимостью выполнить свою работу и желанием защитить человечество от угрозы. Она должна принять сложное решение - уничтожить Моргана или попытаться найти способ его остановить, не прибегая к крайним мерам. В ходе расследования она вступает в конфликт с руководством компании, которое готово пойти на все ради сохранения своего проекта и коммерческой тайны.
Сюжет фильма "Морган" поднимает вопросы этики создания искусственного интеллекта и ответственности за его действия. Героиня сталкивается с моральным выбором, который может иметь далеко идущие последствия не только для нее самой, но и для всего человечества.