После событий первого фильма, где юный Сэм Уитвикки стал ключевой фигурой в борьбе между Автоботами и Десептиконами, он пытается вернуться к обычной жизни. Однако его мир снова переворачивается с ног на голову, когда древний предводитель Десептиконов, Фоллен, возвращается из небытия, стремясь отомстить за своё поражение и уничтожить Землю. Сэм, несмотря на желание начать новую жизнь в колледже, оказывается снова втянутым в конфликт, ведь он является ключом к победе над древним врагом.
Сэм обнаруживает у себя странный татуировку, которая начинает вести его к старинным артефактам и тайнам трансформеров. В поисках ответов он отправляется в Египет вместе с своим другом Миком и девушкой по имени Мэгги. Там они узнают о древней истории трансформеров и их связи с Землёй.
Автоботы, предводимые Оптимусом Праймом, также осознают угрозу, которую представляет Фоллен, и объединяются с Сэмом в борьбе против могущественного врага. В то время как Десептиконы под руководством Мегетрона готовятся к финальной битве за доминирование над планетой.
Сэм и его друзья выясняют, что татуировка является частью древнего пророчества, которое может привести к активации мощного оружия, способного уничтожить как Десептиконов, так и Автоботов. В этой гонке за власть и выживание Сэм должен использовать свои новые знания о трансформерах, чтобы предотвратить катастрофу.
Фильм "Трансформеры: Месть падших" погружает зрителя в мир эпических сражений между роботами-гигантами на фоне земных городов и древних загадок, которые раскрывают тайны происхождения трансформеров.