В центре сюжета фильма "Помогите, я уменьшил своих друзей!" - группа подростков из школы имени Отто Леонарда, чьи жизни кардинально меняются после появления новой ученицы Мелани. Девушка сразу привлекает внимание одного из школьников, Феликса, что вызывает раздражение у его приятелей Эллы и компании. Они подозревают Мелани в связи с серией мелких краж, начавшихся после её поступления.
Когда друзья Феликса почти портят ему свидание с Мелани, обвиняя её в воровстве, парень решает преподать им урок. Он использует магический прибор и уменьшает своих товарищей в десять раз. Однако ситуация выходит из-под контроля, когда Мелани исчезает вместе с тем самым шаром, обладающим магической силой.
Теперь героям предстоит столкнуться с серьёзными последствиями их поступка. Они осознают, что игры с магией могут иметь непредсказуемые и опасные последствия. Подросткам придётся объединиться, чтобы найти Мелани и вернуть всё на свои места, ведь теперь уже не до шуток - нужно разгадать тайну исчезновения девушки и восстановить мир в школе.