Арису Ямабуки, наследник могущественной корпорации Yamabuki Group, всегда стремился к совершенству, но чувствовал, что ему не хватает последнего процента для достижения своих целей. Этот недостающий элемент он нашел в средней школе, слушая радиошоу "Полуночный мотив сердца" с таинственной ведущей Apollo. Однако радость Арису была омрачена, когда шоу внезапно прекратило свое вещание перед окончанием девятого класса.
Поступление в смешанную школу Фурин стало новым этапом в жизни молодого человека. Школа, ранее предназначенная исключительно для девушек, теперь открыла свои двери и для юношей. Арису не знал ни лица, ни имени Apollo, но его надежда на встречу с ней возродилась после того, как он услышал знакомые интонации в голосе одной из учениц.
Однажды, следуя зову своего сердца, Арису ворвался в студию радиовещания и обнаружил там четверых девушек, каждая из которых мечтала о карьере, связанной с голосом. Рикка Инохана стремилась стать известной певицей, Нэнэ Химэкава хотела посвятить себя актерскому мастерству озвучивания, Ико Кирино видела свое будущее в качестве популярного витьюбера, а Синобу Удзуки мечтала о карьере диктора. Все они казались Арису воплощением Apollo.
Стремясь помочь девушкам реализовать их мечты и надеясь узнать больше об Apollo, Арису предложил им свою поддержку. В его сердце зародилась уверенность, что каждая из этих удивительных девушек может быть той самой таинственной ведущей, чьи слова когда-то вдохновили его на поиски совершенства.
История "Полуночный мотив сердца" - это история о поиске себя и своих мечтаний, о дружбе и поддержке, о том, как важно не упустить свой шанс и помочь другим найти их путь. Арису стоит перед выбором: продолжить свои личные стремления или посвятить себя помощи девушкам, чьи голоса напоминают ему о потерянной мечте.