В центре сюжета - Эита Акуцу, молодой человек, увлеченный техникой и ведущий уединенный образ жизни. Его мир переворачивается, когда в его квартиру неожиданно заходит Макина Агацума, девушка из школы, о которой он мечтал. Однако радость Эиты сменяется удивлением: Макина оказывается роботом, созданным для интимных отношений, но лишенным знаний об этом аспекте взрослой жизни.
Механическое тело Макины и её невинность в вопросах взрослых взаимоотношений создают комичные ситуации. Эита, будучи девственником и стеснительным по натуре, испытывает сильное смущение от всего, что связано с интимностью. Несмотря на это, он соглашается скрыть Макину у себя дома, чтобы защитить её от возможных неприятностей.
Их необычное сосуществование начинается как тайна, которую необходимо сохранить любой ценой. Эита старается обучить Макину основным жизненным навыкам и помочь ей понять мир людей, в то время как она учит его быть более открытым и уверенным в себе. Их отношения развиваются на фоне комических ситуаций и недопонимания, которые неизбежны при сочетании робота с человеческими эмоциями и социальными нормами.
Сюжет сериала "Прячься, Макина!" полон юмора и фантастических моментов, где каждый новый день приносит новые испытания для Эиты и его необычной гостьи. Они оба стремятся найти свое место в мире, где технологии и человеческие отношения переплетаются самым неожиданным образом.
