В далёком будущем, когда Земля оказалась на грани уничтожения после вторжения инопланетян, человечество было вынуждено искать убежище на Луне. Последняя надежда рода человеческого возложена на армию андроидов YoRHa - высокотехнологичных воинов, созданных для борьбы с захватчиками и возвращения Земли под контроль людей.
В центре сюжета оказываются два андроида: 2B и 9S, которые отправляются на миссию по изучению состояния планеты. Их задача - собрать информацию о врагах и выживших машинах, которые были оставлены инопланетянами после их ухода.
В ходе своего путешествия героини сталкиваются с множеством испытаний и открытий. Они встречают других андроидов, включая 2B-ю модель А2, которая ранее отступила от своих обязанностей и теперь ведет борьбу против YoRHa. Героиням предстоит разобраться в сложных моральных вопросах войны, идентичности и смысле существования.
С каждым новым заданием, 2B и 9S углубляются в тайны прошлого, настоящего и будущего человечества, сталкиваясь с последствиями своих действий. Их миссия становится не только борьбой против врагов, но и поиском пути к пониманию себя и своего места в этом мире.
Вместе они исследуют разрушенный мир, где каждый шаг может привести к новым открытиям о природе войны, искусственного интеллекта и человечности. Их путешествие затрагивает глубокие философские темы, такие как смысл жизни, свобода воли и ценность существования.