В фильме "Глухомань" рассказывается о жизни 11-летней девочки Хотару Итидзё, которая переезжает из шумного Токио в маленькую японскую деревню. Этот резкий контраст между городской суетой и спокойствием провинции становится ключевым моментом в её жизни. Деревня настолько уединённая, что до ближайшего книжного магазина можно добраться только на поезде, который идёт час. Здесь царит атмосфера доверия и простоты: двери домов не запирают, ведь все жители знают друг друга как родственников.
Хотару начинает учиться в местной школе, где обучаются дети всех возрастов - от первоклассницы Рэнгэ до восьмиклассниц Нацуми и Комари, их брата Сугуру, который старше на год, и теперь ещё и пятиклассница Хотару. Школьная жизнь в деревне кардинально отличается от городской: дети вместе играют, учатся и растут, поддерживая друг друга.
Фильм показывает, как Хотару адаптируется к новой жизни, находит друзей и учится ценить простые радости сельского бытия. Через её глаза зрители видят, как меняется восприятие мира в условиях полной противоположности городской суете - от шумного Токио до тихой глубинки Японии.