В далеком последнем лете двадцатого века человечество столкнулось с неожиданной угрозой: из глубин Земли вырвались гигантские чудовища кайдзю, начавшие разрушать города и сражаться друг с другом. Среди них выделялся Годзилла - могучий ящер с радиоактивным дыханием, ставший самым страшным врагом человечества. Отчаявшись победить монстров, люди приняли решение покинуть родную планету в поисках нового пристанища.
Прошли два десятилетия скитаний в космосе, и надежды на успех миссии стали таять. Молодой Харуто родился уже на борту корабля переселенцев и вырос с убеждением, что человечество поступило трусливо, отказавшись бороться за свою планету. Его идеи о возвращении на Землю находят отклик среди других пассажиров, и они решают использовать экспериментальную технологию гиперскачка для мгновенного перемещения.
В результате неожиданной аномалии переселенцы оказываются не у родных берегов, а через двадцать тысяч лет после своего бегства. Земля изменилась до неузнаваемости: от цивилизации не осталось и следа, а в мире теперь правят чудовища. Годзилла, как и прежде, занимает вершину пищевой цепочки, доминируя над другими кайдзю. Харуто и его спутники сталкиваются с необходимостью выжить в этом новом, опасном мире, где каждый шаг может стать последним.