В четвертом фильме серии "Призрак в доспехах у истоков" Мотоко Кусанаги вместе с командой 9-го отдела общественной безопасности сталкивается с новой угрозой. Их задача - остановить распространение смертельного вируса, получившего название "Поджигатель". Этот вирус способен уничтожать кибермозги, что делает его крайне опасным для людей, частично или полностью заменивших свои мозговые функции искусственными имплантами.
Мотоко и её команда должны не только обнаружить источник заражения, но и понять мотивы неизвестного хакера, стоящего за распространением вируса. В процессе расследования они выясняют, что "Поджигатель" может быть ключом к разгадке более широкого заговора, угрожающего стабильности общества.
Каждый шаг приводит героев к новым открытиям, которые ставят под сомнение их представления о реальности и безопасности. В погоне за истиной Мотоко и её союзники сталкиваются с моральными дилеммами и сложностями в определении грани между человеческим и искусственным.
Фильм исследует темы идентичности, доверия и последствий технологического прогресса для общества. Герои борются не только с внешним врагом, но и со своими внутренними демонами, пытаясь сохранить свою индивидуальность в мире, где граница между человеком и машиной становится всё более размытой.