В мире, где человечество сталкивается с мистическими существами Ангелами, Синдзи Икари продолжает свой путь пилота робота Ева-01. Встреча с новыми пилотами - Мари и Аской - вносит изменения в его жизнь. Аска, обладающая схожими навыками, переезжает к Мисато и начинает учиться вместе с Синдзи и Рэй. Между героями завязываются сложные отношения, а их общение осложняется появлением старого знакомого Мисато - Рёдзи Кадзи.
Силы NERV объединяются для борьбы с Ангелами, но каждый из пилотов сталкивается со своими внутренними демонами. Синдзи, все еще не пришедший в себя после предыдущих битв, пытается найти свое место в мире, где его способности одновременно и спасают человечество, и обрекают на одиночество.
Мари и Аска добавляют новые нюансы в динамику команды. Мари, с ее загадочной улыбкой и непостижимым спокойствием, кажется, скрывает тайны прошлого. Аска же, напротив, открыто демонстрирует свою уверенность и желание победить.
В то время как внешняя угроза Ангелов нарастает, внутренние конфликты героев достигают апогея. Каждый из них борется не только с врагами вне, но и со своими страхами и сомнениями внутри. "Евангелион 2.0: Ты (не) пройдешь" - это история о поиске себя в мире хаоса, о дружбе и любви на фоне глобальной угрозы, и о том, как сложно бывает сделать правильный выбор, когда ставки слишком высоки.