В центре сюжета аниме "Гайвер: Биоударное оружие" - таинственная корпорация "Кронос", занимающаяся опасными экспериментами над Зоаноидами, существами, способными принимать монструозные формы. В ходе одного из опытов одному из подопытных удаётся сбежать, прихватив с собой три загадочных блока. Эти устройства представляют собой ключевую технологию, которую "Кронос" стремится сохранить в своих руках любой ценой.
В поисках свободы и безопасности беглец оставляет после себя один из блоков, который оказывается найденным обычным школьником по имени Сё Фукамачи. Случайное соприкосновение с устройством приводит к его активации, и внезапно вокруг парня формируется мощная биологическая броня - Гайвер. Этот симбиотический биомеханический костюм не только защищает своего хозяина, но и наделяют его грозным вооружением.
Сё теперь обладает невиданными способностями, которые делают его опасным противником для "Кроноса". Корпорация начинает охоту за новым Гайвером, стремясь уничтожить источник угрозы и вернуть утраченную технологию. Сё же должен научиться контролировать свои новые силы и использовать их для защиты себя и своих близких от безжалостных преследователей.
Так начинается история молодого героя, который оказывается втянутым в борьбу между силами добра и зла, где каждая битва может стать последней. Сё Фукамачи превращается из обычного подростка в могущественного Гайвера, биоударное оружие, способное противостоять темным замыслам "Кроноса".
