В мире, где бесконечная война между республикой Сан-Магнолией и империей Гиадиан достигла апогея, технологии автономного оружия стали ключевым фактором выживания. Империя Гиадиан создала "Легион" - серию беспилотных дронов, которые мрачной тенью нависли над Сан-Магнолией. В ответ республика разработала собственное оружие, обещая ведение войны без жертв среди своих граждан.
Однако за фасадом официальной пропаганды скрывается страшная реальность. Существует 86-й сектор - территория, которую правительство предпочитает не признавать, а его жителей считать несуществующими. Молодые люди этого сектора вынуждены управлять автономным оружием, сражаясь в первых рядах против вражеских дронов "Легиона". Каждый день они рискуют своими жизнями, защищая республику, которую даже не признают их родиной.
Сюжет аниме "86" погружает зрителя в мир, где технологии и война переплетены так тесно, что становится невозможно разделить одно от другого. Это история о борьбе за признание, о дружбе и любви на фоне разрушительной войны, о поиске своего пути в мире, который отвергает тех, кто готов пожертвовать всем ради его спасения.