В центре сюжета аниме "Серебряный лис" - Макото Саэки, молодая девушка, которая после смерти матери становится мико в храме плодородия, где её предки служили на протяжении 14 поколений. Особенностью Макото является способность общаться с Гинтаро, духом-хранителем храма в виде лиса-оборотня, который хоть и ленив, но дружелюбен и имеет слабость к апельсинам.
Макото быстро учится исполнять свои обязанности, несмотря на юный возраст. Её отец - настоятель храма, занимается общением с прихожанами, в то время как Макото стремится стать полноценной жрицей. В 16 лет она уже является ответственной и доброжелательной девушкой, но её жизнь не ограничивается только духовными обязанностями.
Макото обладает талантом предсказывать будущее, что делает её популярной среди одноклассников и жителей города. Она искренне радуется приезду Сатору, молодого человека из старинного рода, который привозит с собой не только новые впечатления и романтику в жизнь Макото, но и свою фамильную хранительницу - лисицу.
История "Серебряного лиса" раскрывает тему духовных связей между миром людей и мира божественных существ через призму жизни молодой девушки и её необычного друга - Гинтаро.