В престижной Академии Сэирэи учится Масатика Кудзэ, парень не из числа прилежных студентов и предпочитает прогуливать уроки. Его жизнь меняется, когда он сталкивается с Алей - одноклассницей, обладающей яркой внешностью и острым умом, а также смешанным русско-японским происхождением. Аля известна своим строгим характером, но именно она становится источником неожиданных перемен в обыденности Масатики.
Все начинается с того момента, когда Аля, не подозревая о знании Масатикой русского языка, решает подразнить его, кокетничая по-русски. Этот момент становится поворотным, ведь парень оказывается настоящим мастером русского языка и способен дать достойный отпор в этой невинной игре слов.
Их взаимоотношения начинают усложняться, когда Масатика решает использовать свой тайный навык для сближения с Алей. Он понимает, что за её строгим фасадом скрывается ранимая и чувствительная натура. Их общение становится всё более частым и доверительным, несмотря на первоначальное нежелание Масатики вступать в контакт.
Сюжет сериала "Аля иногда кокетничает со мной по-русски" раскрывает тему культурных различий и сходств через призму романтических отношений между двумя молодыми людьми, чьи сердца медленно, но верно тянутся друг к другу. Каждый новый день в академии приносит новые повороты в их отношениях, наполняя жизнь Масатики неожиданными эмоциями и открытиями.